Afin de filmer les cachalots, les Sauvenature partent pour la baie de San Diego où un mâle a été repéré. Mais à peine le trio a-t-il pu filmer une séquence que le sonar d'un sous-marin américain désoriente l'animal qui s'échoue sur la plage.
Bouleversés, les enfants enquêtent aussitôt auprès de la base militaire de Ballast Point pour en savoir plus.