Quatre mois après l’attaque extraterrestre qui a pratiquement éradiqué la vie sur Terre, les survivants s’organisent et ripostent pour reprendre le contrôle de la planète. Côté anglais, le neuroscientifique Bill Ward (Gabriel Byrne) progresse dans ses recherches : il découvre que les extraterrestres présentent d’étranges similitudes avec les humains et met au point un virus susceptible de les vaincre définitivement. Il s'interroge alors sur la proximité d’Emily (Daisy-Edgar Jones) avec les aliens, celle-ci possédant un étrange tatouage sur le bras.